Kentin güneydoğusundaki Lagos Gölü üzerinde uzanan Third Mainline Köprüsü, adaları anakaraya bağlıyor. Daha önce Nijerya’nın başkenti olan Lagos, güney bölümündeki uzun kum tepeleriyle Atlas Okyanusu’nun hırçın dalgalarından korunuyor. Kentin yerleşim alanları, kum tepelerinin arasından geçip okyanusla buluşan çok sayıda küçük dereyle birbirinden ayrılıyor.